公司交通业务主要由下属子公司国投交通控股有限公司负责。国投交通控股有限公司是国家开发投资公司的全资子公司，是对港口、铁路、航运、路桥等交通基础设施项目公司进行控股参股经营的投资控股型公司,控股经营和在建港口吞吐能力3亿吨;参控股经营铁路约4400公里；航运船队拥有14艘散货船，自有运力达到近100万载重吨，航线遍及美洲、非洲、澳洲、东南亚及国内沿海主要港口。公司注册资本金20亿元人民币，截至2013年底，公司合并总资产225亿元，所有者权益109亿元。  
　　国投交通控股有限公司是国内港口业唯一的中央级权益(经营性基金) 的国家出资人代表，也是央企最大的公共码头运营服务商。目前控股经营：国投曹妃甸煤码头、国投京唐港煤码头、镇江港、洋浦港、国投湄洲湾煤炭码头、国投钦州煤炭码头、国投孚宝洋浦罐区码头、国投湄州湾产业园开发有限公司、国投远东航运有限公司、国投海运发展有限公司。参股经营：南通港、张家港港、宁波港、广州港、唐山港、唐山曹妃甸港、华能曹妃甸港、唐港铁路、福建湄洲湾直线铁路、哈罗铁路、国投财务。  
公司已形成以港口为基础，以煤炭运输为主线，以渤海湾、北部湾和长江三角洲为重点的港口布局。公司紧紧围绕国家能源运输的需求，确保国家能源运输安全，以煤炭下水码头建设为切入点，全力推进铁路、港口资源的整合，公司的控股港口多次在国家的电煤抢运工作中发挥了重要的作用。